A Tornyai János Múzeum 2009 nyarán költözött ki a Dr. Rapcsák András út 16-18. szám alatti épületkomplexumból, mely a 21. század látogatói és múzeumszakmai igényeinek megfelelő módon bővült és újult meg.
Az ősz első napján átadott múzeumépülethez egy háromszintes, modern kialakítású rész épült a Rapcsák András út és a Deák Ferenc utca sarkán, ahol a raktárak és a restaurátorműhelyek kaptak helyet. A földszintre, az ún. átmenő raktárba érkeznek a leletek és a műtárgyak, ahol a muzeológusok és restaurátorok előzetesen megvizsgálják őket. Innen kerülnek tisztításra és kapják vissza eredeti formájukat a Deák Ferenc utcára nyíló műhelyben, ahol az ott zajló munkafolyamatokat akár a járókelők is megtekinthetik az utcára néző ablakokon keresztül. A régészeti gyűjtemény tárolása a pinceszinten történik, míg a helytörténeti és a néprajzi anyag az emeleten kapott helyet.
A legmodernebb gördülő polcos rendszerű raktárak cáfolják azt a közhelyt, miszerint a múzeumok raktáraiban porosodnának a műtárgyak. Tény, hogy a raktárak mélyén – a szakszerűen és áttekinthetően – tárolt tárgyegyüttesekkel csak kivételes alkalmakkor találkozhatnak a látogatók, de ez nem jelenti azt, hogy évtizedekre elfeledve és háborítatlanul „porosodnának”.
Elek András sajtóreferens tájékoztatása szerint az 1905-ben megszületett múzeum legkorábbi anyagát azok a néprajzi tárgyak alapozták meg, amelyeket Tornyai János festőművész útmutatása alapján Kiss Lajos, a későbbi jeles néprajzkutató gyűjtött össze. A több mint 9000 darabos gyűjtemény kiemelkedő részét alkotják Vásárhely népművészeti örökségének emlékei, a festett bútorok, a cserépedények és a szőrhímzéses párnavégek.
A múzeum régészeti osztálya 1930-ban jött létre. A gyűjtemény az elmúlt évtizedben a háromszorosára duzzadt; ma már közel 150 000 darab beleltározott tárgyat tartalmaz. Ennek egy részét képezi az a pénztörténeti egység, mely a régészeti feltárások során előkerült, vagy a múzeumnak ajándékozott ókori és középkori forgalmi pénzekből áll.
A helytörténeti gyűjtemény több mint 8900 db műtárgyat őriz. Legrégebbi darabja egy 1491-ből származó, II. Ulászló által kiadott oklevél. A gyűjtemény legnagyobb részét a vásárhelyi céhek, a helyi iparszervezetek emlékei alkotják, de őrzi Vásárhely polgárainak hagyatékát, a város politikai és kulturális életének emlékeit is. A Tornyai János Múzeum képzőművészeti gyűjteménye az Alföldi Galériában van elhelyezve.
